华体会登录口:GEO数据库介绍 (一)

   刊发时间:2021-09-07 06:35:24   来源:华体会网站链接 作者:华体会电竞官网入口

  前几天通过岛上日子来和咱们了解了一下根本的生信剖析文章的思路是什么姿态的从荒岛求生看公共数据库生信剖析文章。今日就和咱们来学习一下GEO数据库,这个寄存公共高通量测序数据的当地。

  GEO数据库是一个贮存芯片、二代测序以及其他高通量测序数据的一个数据库。运用这个数据库,咱们能够检索到其他一些人上传的一些试验测序数据。

  不触及任何检测原理的视点来说的话,所谓的高通量检测,其实便是一次性检测许多方针改动的技能。例如咱们说的表达谱数据,便是来检测基因表达水平。比方咱们要对一个人来进行高通量检测的话,就能知道这个人上万个基因的表达水平了。

  因为GEO数据库和咱们之前介绍的gene数据库[数据库引荐]gene:基因相关信息查询以及咱们常用来查找文献的pubmed都是一个组织的。运用这个数据库,咱们需求做的便是便是便是供给检索式。检索式能够是简略的几个关键词,也能够是拟定特其他检索式。

  2.因为GEO包含了许多不同组学的数据,假如咱们有特定的检索意图的话,咱们能够在Study Type傍边来挑选适宜的数据类型。

  3.默许的检索成果的排序是根据检索相关性来排序的。而咱们再找方针数据的时分。有时分需求看样本量,一般来说样本量越大其实也就越好的。所以咱们能够改动一下检索成果的排序。

  假如想要检查数据集的详细信息,咱们就能够点击数据集的相关链接,就能够到了了。关于数据集内的详细信息。因为篇幅的约束,咱们明日再做介绍。接下来是咱们岛上的生计日记。

  上岛的第一天,首要,咱们能够调查一下咱们这个岛,这个岛的中心由河流分成了,三个部分。因为上岛的第一天什么都没有,本身事务才能仍是太差。所以也没办法进入到其他当地去。只能在很小的范围内活动了。

  岛上日子的第一天,便是了解了解周围的环境,一穷二白来到岛上的我,除了一双勤劳的双手。第一次到一个当地,仍是有有一个坐的当地,所以我就想自己着手做一个凳子(胃癌)。同样是制作凳子,根据资料的不同咱们就能够制作不同款式的凳子。通过我在岛上的疯跑,我发现岛上有许多资料能够做凳子,比方说,我就发现了石头和木材。

 

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