华体会登录口:GEO数据库及运用场景介绍

   刊发时间:2021-09-07 06:35:42   来源:华体会网站链接 作者:华体会电竞官网入口

  Series: 多个样本连接成一个完好的研讨数据集,并供给了整个研讨的描绘,包含对数据的描绘,总结剖析。现在共有96445个研讨。

  Platforms: 用户提交给GEO数据中涉及到的芯片/测序渠道,现在GEO上包含了18300种渠道的数据。

  DataSets: GEO工作人员依据用户提交的数据收拾后得到的数据集,类似于TCGA的level4数据,现在共有4348个。

  Profiles:GEO工作人员依据用户提交的数据收拾后的数据,倾向于某个基因在不同数据会集的表单状况。

  GEO数据库支撑关键字检索和布尔逻辑,和运用pubmed十分类似,一般咱们检索都是DataSets数据。

  GEO数据是能够直接在线下载的,十分简略,一起GEO供给了多种数据的下载格局,主要有四种方式:1

  SOFT格局和MINIML格局的数据下载的是一个压缩包,解压之后里边有各个样本的独自的表达数据,还有渠道的注释数据以及样本信息,其间样本信息是XML文件,其他为TXT格局的数据。2

 

版权所有: 华体会登录口网站链接_华体会电竞官网入口 

京ICP备05050114号      400-160-1670